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近年来国家加大了知识产权的保护力度和对侵犯知识产权行为的查处打击力度，企业可以从以下几个方面来保护本企业的知识产权：（1）建立企业的知识产权管理制度和设置企业的知识产权管理机构，（2）软件企业应增强知识产权保护意识并充分了解法律适用，目前国际社会已形成以《著作权法》保护为主，《著作权法》(包括《计算机软件保护条例》)、《专利法》、《商标法》、《反不正当竞争法》、《合同法》实施交叉和重叠保护为辅的趋势。首先应当明确软件知识产权归属问题，是归企业还是制作、设计、开发人员所有;其次是软件技术秘密的认定、保密措施问题。企业对自己的软件产品或成果中的技术秘密，就当主动采取保密措施;还有专利的保护问题。企业的软件科技或者产品构成专利法律要件的，应当尽早办理申请专利权登记事宜，千万不要因企业自身的延误，造成企业软件成果;软件产品进入市场之前的商标权和商业信息的保护问题；最重要的一点是企业的软件产品进入市场之前就进行申请软件著作权登记。要防范被人抢先登记，（3）软件企业应当学会按照经济合同规范调整各种关系，建立企业内部以及企业与外部的各种经济约束机制是当务之急。一是劳动关系合同。软件企业与企业职工、外聘人员之间应建立合法的劳动关系，以及应就企业的商业秘密(技术秘密和经营秘密)的保密事宜进行约定，建立劳动利益关系合同以及保守企业商业秘密的协议。二是软件开发合同。软件企业与外单位合作开发、委托外单位开发软件时，应建立软件权利归属关系等事宜的协议，可按照有关规定签订软件开发合同，约定软件开发各方面尚未开发的软件享有的权利与义务的关系，以及软件技术成果开发完成后的权利归属关系和经济利益关系等。三是软件许可使用(或者转让)合同。软件企业在经营本企业的软件产品时，应当建立“许可证”(或是转让合同)制度，用软件许可合同(授权书)或者转让合同的方式，来明确规定软件使用权的许可(转让)方式、条件、范围、时间等事宜。（4）软件企业应尊重他人的知识产权，积极保护自己的合法权益。一旦发生纠纷诉讼，应当正视现实，认真对待。一方面弄清对方是否有权提起诉讼；另一方面，检查自己的行为是否构成侵权。
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