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根据你所说的情况来看，双方签订的内退协议可以作为证据使用，但是由于单位并未盖章，可能需要在法庭进行质证，由法院决定是否采纳。《民事诉讼法》把证据分为：书证、物证、视听资料、证人证言、电子数据、当事人的陈述、鉴定意见、勘验笔录。最高人民法院《证据规定)第64条将民事诉讼法这一规定细化为“审判人员应当依照法定程序，全面、客观地审核证据，依据法律的规定，遵循法官职业道德，运用逻辑推理和日常生活经验，对证据有无证明力和证明力大小独立进行判断，并公开判断的理由和结果。”从司法实践来看，法律直接规定证据证明力有无和大小的情况并不多，多数情况仍然需要靠审判人员的判断，即要求审判员按照良知、理性、经验规则对证据证明力有无和大小进行判断。这就不能排除审判员判断的自由度，没有自由度也就不能根据案件具体情况来进行认定。
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