您好，云法律网专业民劳动工伤律师为您解答如下：
你的工资是底薪加提成模式发放的，一般来说，基本工资是不允许扣除的（即底薪），扣除5000元，如果低于你的底薪，低于当地最低工资标准，是违法的；底薪加提成的工资方式，提成在劳动合同中应当有明确的计算方法，你们公司应当按照底薪加你实际应得的提成对你进行发放工资，不允许其设定惩罚性克扣工资的规定，单位不满员工的工作效率的，可以予以辞退并支付相应经济补偿金，而不是制定罚扣工资的违法规定。建议咨询当地劳动监察部门，如公司确有侵权的，应当及时向劳动部门反映或者提起仲裁。克扣工资是指用人单位无正当理由扣减劳动者应得工资。不包括以下减发工资的情况：（1）国家的法律、法规中有明确规定的；（2）依法签订的劳动合同中有明确规定的；（3）用人单位依法制定并经职代会批准的厂规、厂纪中有明确规定的；（4）企业工资总额与经济效益相联系，经济效益下浮时，工资必须下浮的（但支付给劳动者工资不得低于当地最低工资标准）；（5）因劳动者请事假等相应减发工资等。
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